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"['\\n///// ', '\\n// Band Arithmetic ', '\\n///// ', '\\n// Calculate NDVI using Sentinel 2 ', '\\n// Import and filter imagery by location and date. ', '\\n// Display the image as a false color composite. ', '\\n// Extract the near infrared and red bands. ', '\\n// Calculate the numerator and the denominator using subtraction and addition respectively. ', '\\n// Now calculate NDVI. ', '\\n// Add the layer to our map with a palette. ', '\\n// Now use the built-in normalizedDifference function to achieve the same outcome. ', '\\n// Use normalizedDifference to calculate NDWI ', '\\n// Create an NDVI image using Sentinel 2. ', '\\n// And map it. ', '\\n// Implement a threshold. ', '\\n// Map the threshold. ', '\\n// Implement .where. ', '\\n// Create a starting image with all values = 1. ', '\\n// Make all NDVI values less than -0.1 equal 0. ', '\\n// Make all NDVI values greater than 0.5 equal 2. ', '\\n// Map our layer that has been divided into three classes. ', '\\n// Implement masking. ', \"\\n// View the seaVeg layer's current mask. \", '\\n// Create a binary mask of non-forest. ', '\\n// Update the seaVeg mask with the non-forest mask. ', '\\n// Map the updated Veg layer ', '\\n// Map the updated mask ', '\\n// Implement remapping. ', '\\n// Remap the values from the seaWhere layer. ', '\\n// Create an Earth Engine Point object over Milan. ', '\\n// Filter the Landsat 8 collection and select the least cloudy image. ', '\\n// Center the map on that image. ', '\\n// Add Landsat image to the map. ', '\\n// Combine training feature collections. ', '\\n// Define prediction bands. ', '\\n// Sample training points. ', '\\n//////////////// CART Classifier /////////////////// ', '\\n// Train a CART Classifier. ', '\\n// Classify the Landsat image. ', '\\n// Define classification image visualization parameters. ', '\\n// Add the classified image to the map. ', '\\n/////////////// Random Forest Classifier ///////////////////// ', '\\n// Train RF classifier. ', '\\n// Classify Landsat image. ', '\\n// Add classified image to the map. ', '\\n//////////////// Unsupervised classification //////////////// ', '\\n// Make the training dataset. ', '\\n// Instantiate the clusterer and train it. ', '\\n// Cluster the input using the trained clusterer. ', '\\n// Display the clusters with random colors. ', '\\n// Import the reference dataset. ', '\\n// Define the prediction bands. ', '\\n// Split the dataset into training and testing sets. ', '\\n// Train the Random Forest Classifier with the trainingSet. ', \"\\n// Now, to test the classification (verify model's accuracy), \", '\\n// we classify the testingSet and get a confusion matrix. ', '\\n// Print the results. ', '\\n// Hyperparameter tuning. ']\n"
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"--------------------------------------------------\n",
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")\n",
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"--------------------------------------------------\n",
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")\n",
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"--------------------------------------------------\n",
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")\n",
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"--------------------------------------------------\n",
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")\n",
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"--------------------------------------------------\n",
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")\n",
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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||||||
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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||||||
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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||||||
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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||||||
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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||||||
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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||||||
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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||||||
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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||||||
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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||||||
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"--------------------------------------------------\n",
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")\n",
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||||||
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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"--------------------------------------------------\n",
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"--------------------------------------------------\n",
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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"--------------------------------------------------\n",
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")\n",
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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||||||
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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||||||
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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||||||
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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||||||
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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||||||
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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||||||
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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||||||
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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||||||
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
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||||||
|
")\n",
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||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
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")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
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||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
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||||||
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")\n",
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||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"}\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"}\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"}\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"]\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"'\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"]\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"]\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"]\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"}\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"}\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"]\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"0\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"'\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"'\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"'\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"0\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"1\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"'\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"'\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"r\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"'\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"'\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"0\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"'\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"}\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"'\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"'\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"}\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n",
|
||||||
|
"--------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
")\n"
|
||||||
]
|
]
|
||||||
}
|
}
|
||||||
],
|
],
|
||||||
"source": [
|
"source": [
|
||||||
"import re\n",
|
"import re\n",
|
||||||
"\n",
|
"\n",
|
||||||
"def captions(f):\n",
|
"def captions(f): # add captions to figures\n",
|
||||||
" regex=r'(!\\[\\].+\\))\\n(\\nFig\\..*)'\n",
|
" regex=r'(!\\[\\].+\\))\\n(\\nFig\\..*)' # find figures\n",
|
||||||
"\n",
|
"\n",
|
||||||
" figures=re.findall(regex, f)\n",
|
" figures=re.findall(regex, f) # find figures\n",
|
||||||
" print(len(figures))\n",
|
" print(len(figures)) # number of figures\n",
|
||||||
" sub=[]\n",
|
" sub=[] # list of figures with captions\n",
|
||||||
" for fig in figures:\n",
|
" for fig in figures: # for each figure\n",
|
||||||
" formatted=fig[0].replace('[]','[{}]'.format(fig[1].replace('\\n','')))\n",
|
" formatted=fig[0].replace('[]','[{}]'.format(fig[1].replace('\\n',''))) # add caption\n",
|
||||||
" f=f.replace(fig[0],formatted)\n",
|
" f=f.replace(fig[0],formatted) # replace figure with formatted figure\n",
|
||||||
" f=f.replace(fig[1],\"\")\n",
|
" f=f.replace(fig[1],\"\") # remove caption\n",
|
||||||
" return f\n",
|
" return f\n",
|
||||||
"\n",
|
"\n",
|
||||||
"def codeblocks(f):\n",
|
"def codeblocks(f):\n",
|
||||||
" \n",
|
" \n",
|
||||||
" regex=r'(\\n//.*)'\n",
|
" regex = r\"^\\/\\/.*(\\n|.)*?;\"\n",
|
||||||
" code=re.findall(regex, f)\n",
|
" pattern = re.compile(regex, re.MULTILINE)\n",
|
||||||
" print(len(code))\n",
|
" matches = pattern.findall(f)\n",
|
||||||
" print(code)\n",
|
" for match in matches:\n",
|
||||||
|
" print('-'*50)\n",
|
||||||
|
" print(match)\n",
|
||||||
" return f\n",
|
" return f\n",
|
||||||
"\n",
|
"\n",
|
||||||
"for i in [2]:#,4,5,6]:\n",
|
"for i in [2,4,5,6]:\n",
|
||||||
" f = open(\"F{}.qmd\".format(i), \"r\").read().replace('\\xa0', ' ')\n",
|
" f = open(\"F{}.qmd\".format(i), \"r\").read().replace('\\xa0', ' ')\n",
|
||||||
" #f = captions(f)\n",
|
" #f = captions(f)\n",
|
||||||
" f = codeblocks(f)\n",
|
" #text_file = open(\"F{}.qmd\".format(i), \"w\")\n",
|
||||||
"\n"
|
" #n = text_file.write(f)\n",
|
||||||
|
" #text_file.close()\n",
|
||||||
|
" f = codeblocks(f) "
|
||||||
]
|
]
|
||||||
},
|
},
|
||||||
{
|
{
|
||||||
|
|||||||
@@ -1,4 +1,4 @@
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